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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
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 Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
适用于以下细胞类型的文库制备：
癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
以及细针抽吸（FNA）细胞；
生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。
  Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建的详细资料：

欢迎您致电 重庆市华雅干细胞技术有限公司 189 9633 2596  Q 3148795229

华雅干细胞-客服中心：023-630105781

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建

品牌：Rubicon Genomics

货号：R300669

规格：24Rxns

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建

单细胞起始的DNA测序文库构建

SMARTer® PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit

· 高重现性和准确性：可用于CNV、SNV和非整倍体检测
· 在SNV和CNV检测方面优于MDA技术
· 三小时的工作流程，手动操作时间不到30分钟
· 均匀的高覆盖率，低的等位基因插入率和脱扣率

应用：

适用于以下细胞类型的文库制备：

· 癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
   以及细针抽吸（FNA）细胞；
· 生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
· 发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
· 宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。

 

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产品说明：
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一种旨在从单细胞中生成高质量的DNA文库，以便在Illumina平台进行测序的试剂盒。该试剂盒基于PicoPLEX技术，优化用于检测拷贝数变异 (CNVs)、单核苷酸变异 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和结构变异 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV检测中表现出比MDA技术更好的性能。 
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要单独购买。
PicoPLEX WGA是一种在被广泛用于检测单细胞中CNV的全基因组扩增（WGA）技术。初，PicoPLEX技术主要用于高再现性的检测非整倍体异倍性和CNV。为了满足准确检测SNV的需求，对PicoPLEX WGA技术中的酶、引物和protocols进行了进一步优化，不仅提升了扩增的覆盖度、*性、准确性，同时提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重现性。
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定细胞或非固定细胞起始，只需简单的4步操作流程，即可在3小时内完成Illumina NGS文库的构建，且手动操作时间非常短。
 

SMARTer DNA HT dual index kits

SMARTer DNA HT dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列对应的index引物，多可提供384种不同的双端index，用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个的不同条形码标记的index微孔板中，每个微孔板可提供不同的96种index组合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每个孔提供的量足够进行一次测序反应；另一种是一套中有24个单独的反应管，每个反应管中包含不同的双端index组合（Code No.R400664），且每个反应管（24N）提供的量足够进行两次测序反应。
 

SMARTer DNA unique dual index kits

SMARTer DNA unique dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“IDT for Illumina UD”对应的index引物，多可提供96种不同双端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中，其中每组可提供24种不同index引物组合（Code No.R400665-R400668）。每个index引物管（24U Sets A-D）提供的量足够进行两次测序反应。
 

SMARTer DNA single index kits

SMARTer DNA single index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与“TruSeq LT set A”序列对应的index引物，可提供24种单端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中，其中每组可提供12种不同index引物组合（Code No.R400695和R400697）。每个index引物管（12U Sets A-B）提供的量足够进行8次测序反应。
 

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图1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技术。
PicoPLEX Gold的技术概要。通过step1裂解细胞获得gDNA，通过随机引物进行预扩增 (step 2)，然后进行指数扩增得到测序文库（step 4）。
 
图2. PicoPLEX Gold的主要特点：高覆盖度，高均匀性，和高重现性 (与A产品技术相比)。
Panel A. 图中显示在不同深度的测序中覆盖的碱基数 (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在较低深度的覆盖度与A产品 (MDA) 相似，在较高深度的覆盖度高于A产品（MDA）。
Panel B. 以gDNA样本 (NA12878) 和单细胞样本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A产品进行全基因组扩增。相比较于MDA，PicoPLEX Gold显示出更均匀的覆盖度。
Panel C. 评估覆盖度的重现性。与A产品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在两个单细胞群之间的*性明显更好。
 

图3. 使用PicoPLEX Gold进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测。
Panel A. 以单细胞（1c），5个细胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始，比较A产品（MDA），PicoPLEX Gold（PP Gold）和SMARTer PicoPLEX WGA（PP WGA）这3个试剂盒之间的SNV检测率。其中1个和5个细胞的测序深度为35M read pairs， gDNA样品深度为40M read pairs。PicoPLEX Gold（蓝色）有高的保真度和覆盖度，与A产品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比，可以高质量的检测更多的SNV（2-9倍），具有明显的优势。
Panel B. PicoPLEX Gold（蓝色）的B等位基因频率的对称分布，以0.5为中心，展示两个等位基因的平衡情况。与A产品（MDA）相比，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）。
Panel C. PicoPLEX Gold的无偏扩增, 在测试的所有单细胞文库制备的技术中，表现出低的等位基因脱扣率（假阴性）。
Panel D. PicoPLEX Gold试剂盒中的聚合酶具有高保真度（蓝色），使得等位基因插入率与A产品（灰色）相当，且显著低于PicoPLEX WGA（紫色）。

 

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Rubicon拥有ThruPLEX®和PicoPLEX®技术。特殊的引物或接头设计，能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。

ThruPLEX DNA-seq  Kit

 更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平台

更高的通量–多达 96 个 index

微量起始样品（50 pg – 50 ng），更高性能

快速简单的实验方法：一根管或孔中，仅三步反应，约 2 小时时间，无需转移

适用于所有主要的靶向富集平台–安捷伦 SureSelect® Enrichment，罗氏 NimbleGen® SeqCap EZ®，IDT xGEN® LockDown® probes

 ThruPLEX Plasma-seq Kit

 专为血浆游离DNA设计

专为cfDNA设计：修复及连接试剂配方更新，方法优化

高品质NGS文库：在宽广的GC含量范围内，可以达到高检测再现性

起始量范围广：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速简便：单管、2小时、3步操作步骤，无需纯化或样品转移步骤

应用领域：液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建

兼容自动化平台：Beckman® FXP Workstation

Takara&Clontech NGS系列产品

品牌/生产厂家产品编号产品名称单位
Rubicon GenomicsR300381PicoPLEX DNA-seq Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR30050PicoPLEX WGA Kit50Rxns
Rubicon GenomicsR300644PicoPLEX WGA Kit 500Rxns
Rubicon GenomicsR300669SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit24Rxns
Rubicon GenomicsR300670SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR300698SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit384Rxns
Rubicon GenomicsR300671SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit24Rxns
Rubicon GenomicsR300672SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR300673SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit480Rxns
Rubicon GenomicsR400406ThruPLEX DNA-seq 48D Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400407ThruPLEX DNA-seq 96D Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR400427ThruPLEX DNA-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400428ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400490ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400491ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400492ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR400523ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400584ThruPLEX Tag-seq 6S（12）Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400585ThruPLEX Tag-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400586ThruPLEX Tag-seq 96D Kit96Rxns

 

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产品相关关键字： DNA测序文库构建 单细胞DNA-Seq分析 授权代理 循环肿瘤细胞（CTC） Takara R300669
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